Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1D2Q14995 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms