Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDE6HQ13956 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE6HQ13956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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