Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPK1Q13546 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIPK1Q13546 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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