Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SKP2Q13309 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKP2Q13309 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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SKP2Q13309 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SKP2Q13309 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SKP2Q13309 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SKP2Q13309 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP2Q13309 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SKP2Q13309 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SKP2Q13309 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKP2Q13309 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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