Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SCGB2A2Q13296 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SCGB2A2Q13296 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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