Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCOCO2Q13137 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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