Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 AAP1YHR047C 2571 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 GAL10YBR019C 2100 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 GLO2YDR272W 825 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YPT32YGL210W 669 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 KRE9YJL174W 831 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 SPC42YKL042W 1092 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YET2YMR040W 483 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 PEX32YBR168W 1242 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YAP1YML007W 1953 nt5.32□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG20YDL113C 1923 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 EIS1YMR031C 2532 nt5.32□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 RTT103YDR289C 1230 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 RRT7YLL030C 342 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 HOR7YMR251W-A 180 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 DCC1YCL016C 1143 nt5.31□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 ARP1YHR129C 1155 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 SPO12YHR152W 522 nt5.3□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 SEC17YBL050W 879 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 LEM3YNL323W 1245 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 RPL21BYPL079W 483 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 FES1YBR101C 873 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 FOB1YDR110W 1701 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 NOP2YNL061W 1857 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 VMA13YPR036W 1437 nt5.3□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YDR396WYDR396W 501 nt5.29□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR509WYDR509W 348 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 MPM1YJL066C 759 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 TIF34YMR146C 1044 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 EPS1YIL005W 2106 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 KIP2YPL155C 2121 nt5.29□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YDR132CYDR132C 1488 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 PCL6YER059W 1263 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 NQM1YGR043C 1002 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 MSA2YKR077W 1092 nt5.28□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF2Q12221 SED5YLR026C 1023 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 YPL168WYPL168W 1293 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 APJ1YNL077W 1587 nt5.28□□□□□ -1.56 RIP-Chip
PUF2Q12221 TAH18YPR048W 1872 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF2Q12221 RBA50YDR527W 1320 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 CLP1YOR250C 1338 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 AVT3YKL146W 2079 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SCM3YDL139C 672 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 GCS1YDL226C 1059 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 UTR4YEL038W 684 nt5.27□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF2Q12221 YKR075CYKR075C 924 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 PML1YLR016C 615 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 BUD28YLR062C 378 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SCO1YBR037C 888 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 CCZ1YBR131W 2115 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 BRF1YGR246C 1791 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 CST6YIL036W 1764 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 HPF1YOL155C 2904 nt5.26□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF2Q12221 ECM3YOR092W 1842 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SEH1YGL100W 1050 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 EDC1YGL222C 528 nt5.26□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF2Q12221 REX3YLR107W 1215 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SCP1YOR367W 603 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YIR007WYIR007W 2295 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 RKM4YDR257C 1485 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 ROG3YFR022W 2202 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 RPN12YFR052W 825 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 GTO1YGR154C 1071 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 APN1YKL114C 1104 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 ARR1YPR199C 885 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 STE50YCL032W 1041 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 VTH1YIL173W 4650 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 VTH2YJL222W 4650 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 FOL1YNL256W 2475 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 RFA1YAR007C 1866 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SFB3YHR098C 2790 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MET7YOR241W 1647 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MNN10YDR245W 1182 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 BGL2YGR282C 942 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MTF1YMR228W 1026 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SUE1YPR151C 621 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 LPL1YOR059C 1353 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 VPS1YKR001C 2115 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 RPT4YOR259C 1314 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 NUP1YOR098C 3231 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 TNA1YGR260W 1605 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 ACC1YNR016C 6702 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MCM6YGL201C 3054 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 UPS3YDR185C 540 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MRPL25YGR076C 474 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 ADD66YKL206C 804 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YLR311CYLR311C 348 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YNL019CYNL019C 855 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YNL033WYNL033W 855 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 POR1YNL055C 852 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 RPA49YNL248C 1248 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YOR024WYOR024W 324 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YLH47YPR125W 1365 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 TRP3YKL211C 1455 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.1 ms