Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP4Q09028 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP4Q09028 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP4Q09028 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms