Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ERCC6Q03468 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ERCC6Q03468 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
ERCC6Q03468 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms