Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP2C1P98194 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2C1P98194 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2C1P98194 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms