Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF2IP78347 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2IP78347 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms