Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB15P59190 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB15P59190 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB15P59190 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB15P59190 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB15P59190 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB15P59190 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB15P59190 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB15P59190 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB15P59190 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB15P59190 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB15P59190 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB15P59190 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB15P59190 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB15P59190 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB15P59190 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB15P59190 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB15P59190 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms