Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP1P59025 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP1P59025 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP1P59025 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP1P59025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP1P59025 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP1P59025 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP1P59025 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP1P59025 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP1P59025 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP1P59025 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP1P59025 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP1P59025 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP1P59025 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP1P59025 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP1P59025 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP1P59025 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP1P59025 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP1P59025 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP1P59025 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP1P59025 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP1P59025 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP1P59025 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP1P59025 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP1P59025 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP1P59025 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP1P59025 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP1P59025 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP1P59025 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP1P59025 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP1P59025 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTP1P59025 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms