Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24CP53992 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24CP53992 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms