Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A1P53985 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A1P53985 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A1P53985 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms