Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK3P51956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK3P51956 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK3P51956 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK3P51956 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK3P51956 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK3P51956 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK3P51956 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK3P51956 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK3P51956 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK3P51956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK3P51956 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK3P51956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms