Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RANGAP1P46060 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RANGAP1P46060 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RANGAP1P46060 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms