Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCG1P45844 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCG1P45844 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms