Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXA10P31260 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms