Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD10P28358 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD10P28358 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms