Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME2P22392 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME2P22392 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME2P22392 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NME2P22392 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NME2P22392 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME2P22392 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME2P22392 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME2P22392 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME2P22392 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME2P22392 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME2P22392 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME2P22392 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME2P22392 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME2P22392 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME2P22392 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME2P22392 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME2P22392 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME2P22392 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME2P22392 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME2P22392 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME2P22392 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME2P22392 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME2P22392 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms