Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCB4P21439 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms