Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCP20941 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCP20941 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCP20941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCP20941 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCP20941 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCP20941 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCP20941 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCP20941 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCP20941 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCP20941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCP20941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCP20941 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCP20941 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCP20941 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCP20941 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCP20941 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCP20941 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms