Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM1P13164 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM1P13164 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms