Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BMP3P12645 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BMP3P12645 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BMP3P12645 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BMP3P12645 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BMP3P12645 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BMP3P12645 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BMP3P12645 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BMP3P12645 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BMP3P12645 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BMP3P12645 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BMP3P12645 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BMP3P12645 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BMP3P12645 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BMP3P12645 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BMP3P12645 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BMP3P12645 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms