Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1P11940 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1P11940 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms