Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTA3P0C7M3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms