Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNB1P01574 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFNB1P01574 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFNB1P01574 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms