Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD4O95243 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD4O95243 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MBD4O95243 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MBD4O95243 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD4O95243 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD4O95243 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD4O95243 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD4O95243 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MBD4O95243 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MBD4O95243 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD4O95243 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD4O95243 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD4O95243 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MBD4O95243 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MBD4O95243 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD4O95243 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MBD4O95243 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MBD4O95243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD4O95243 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD4O95243 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MBD4O95243 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MBD4O95243 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MBD4O95243 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD4O95243 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD4O95243 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD4O95243 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD4O95243 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD4O95243 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD4O95243 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD4O95243 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD4O95243 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MBD4O95243 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD4O95243 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms