Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA5O60264 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCA5O60264 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms