Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
N4BP3O15049 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP3O15049 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms