Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC188H7C350 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC188H7C350 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms