Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBY3A6NI87 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBY3A6NI87 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms