Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POTEMA6NI47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEMA6NI47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEMA6NI47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms