Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
U3KQE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
U3KQE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
U3KQE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
U3KQE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
U3KQE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
U3KQE9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
U3KQE9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms