Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms