Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN7Q9Y6W3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms