Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGB2Q9Y5G2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms