Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC2Q9Y235 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC2Q9Y235 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC2Q9Y235 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 715.1 ms