Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SORCS3Q9UPU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORCS3Q9UPU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms