Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4AQ9UMR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms