Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NPC1L1Q9UHC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPC1L1Q9UHC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NPC1L1Q9UHC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms