Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTSFQ9UBX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTSFQ9UBX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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