Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC17A6Q9P2U8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC17A6Q9P2U8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms