Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK12Q9NYV4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK12Q9NYV4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK12Q9NYV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms