Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA3Q9NST1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms