Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BATF3Q9NR55 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BATF3Q9NR55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms