Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHACTR1Q9C0D0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHACTR1Q9C0D0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms