Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF4Q9BZC1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF4Q9BZC1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF4Q9BZC1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms