Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NIFKQ9BYG3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NIFKQ9BYG3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms